Челик (Черногория) - Металлург Донецк (Украина) 2:4 (первый матч - 0:7)
Ордабасы (Казахстан) - Русенборг (Норвегия) 1:2 (первый матч - 2:2)
Ширак (Армения) - Бней-Иегуда (Израиль) 0:1 (первый матч - 0:2)
Дила (Грузия) - Орхус (Дания) 3:1 (первый матч - 2:1)
Металург Скопье (Македония) - Рух Хожув (Польша) 0:3 (первый матч - 1:3)
Гандазасар (Армения) - Серветт (Швейцария) 1:3 (первый матч - 0:2)
Куопио (Финляндия) - Маккаби Нетания (Израиль) 0:1 (первый матч - 2:1)
Актобе (Казахстан) - Милсами (Молдавия) 3:0 (первый матч - 2:4)
Гомель (Беларусь) - Ренова (Македония) 0:1 (первый матч - 2:0)
Интер Турку (Финляндия) - Твенте (Голландия) 0:5 (первый матч - 1:1)
Эльфсборг (Швеция) - Дачия (Молдавия) 2:0 (первый матч - 0:1)
Гонвед (Венгрия) - Анжи (Россия) 0:4 (первый матч - 0:1)
МЮПА (Финляндия) - Рапид Бухарест (Румыния) 0:2 (первый матч - 1:3)
Судува (Литва) - Войводина (Сербия) 0:4 (первый матч - 1:1)
Олесунн (Норвегия) - Тирана (Албания) 5:0 (первый матч - 1:1)
ЦСКА София (Болгария) - Мура (Словения) 1:1 (первый матч - 0:0)
Кальмар (Швеция) - Осиек (Хорватия) 3:0 (первый матч - 3:1)
Анортосис (Кипр) - Левадия (Эстония) 3:0 (первый матч - 3:1)
Рид (Австрия) - Шахтёр Солигорск (Беларусь) 0:0 (первый матч - 1:1)
Гент (Бельгия) - Дифферданж (Люксембург) 3:2 (первый матч - 1:0)
Сеница (Словакия) - АПОЭЛ (Кипр) 0:1 (первый матч - 0:2)
Виктория Пльзень (Чехия) - Металлург Рустави (Грузия) 2:0 (первый матч - 3:1)
Слайго Роверс (Ирландия) - Спартак Трнава (Словакия) 1:1 (первый матч - 1:3)
Витесс (Голландия) - Локомотив Пловдив (Болгария) 3:1 (первый матч - 4:4)
Зета (Черногория) - Ювяскюля (Финляндия) 1:0 (первый матч - 2:3)
Лех (Польша) - Хазар (Азербайджан) 1:0 (первый матч - 1:1)
Астерас (Греция) - Интер Баку (Азербайджан) 1:1, по пен. 4:2 (первый матч - 1:1)
Тромсе (Норвегия) - Олимпия Любляна (Словения) 1:0, в доп. время (первый матч - 0:0)
Зимбру (Молдавия) - Янг Бойз (Швейцария) 1:0, по пен. 4:1 (первый матч - 0:1)
Сконто (Латвия) - Хайдук (Хорватия) 1:0 (первый матч - 0:2)
Црвена Звезда (Сербия) - Нафтан (Беларусь) 3:3 (первый матч - 4:3)
Видеотон (Венгрия) - Слован Братислава (Словакия) 0:0 (первый матч - 1:1)
Легия (Польша) - Металлург Лиепая (Латвия) 5:1 (первый матч - 2:2)
Сент-Патрикс (Ирландия) - Широки Бриег (Босния и Герцеговина) 2:1, в доп. время (первый матч - 1:1)
Сент-Джонстон (Шотландия) - Эскишехирспор (Турция) 1:1 (первый матч - 0:2)
Портадаун (Сев. Ирландия) - Славен (Хорватия) 2:4 (первый матч - 0:6)
Сараево (Боснияи Герцеговина) - Левски (Болгария) 3:1 (первый матч - 0:1)
Адмира Медлинг (Австрия) - Жальгирис (Литва) 5:1 (первый матч - 1:1)
Тор (Исландия) - Млада-Болеслав (Чехия) 0:1 (первый матч - 0:3)
Хабнарфьордюр (Исландия) - АИК (Швеция) 0:1 (первый матч - 1:1)